इन्डस सिंक्रोटॅान परिसर के इंजेक्टर के रूप में एक 20 मेगा वोल्ट माइक्रोट्रॅान का उपयोग किया जाता है। इस उद्देश्य के लिए पहला माइक्रोट्रॅान 1994 में शुरू किया गया था। बेहतर डिजाइन के साथ एक नया इंजेक्टर माइक्रोट्रॅान 2017 में शुरू किया गया है।

1. इंजेक्टर माइक्रोटॅान - इंजेक्टर माइक्रोटान के बीम मापदंड 20 मेगवोल्ट, 20 मिली एम्पीयर, 1 हट्रज है।
   

   
   चित्र - 4 इन्डस सिंक्रोटॅान परिसर में स्थापित इंजेक्टर माइक्रोटॅान
   

2. मैंगलोर विश्वविद्यालय के लिए माइक्रोटॅान - 8 मेगावोल्ट का माइक्रोट्रॅान 1995 में आपूर्ति किया गया था और तब से लेकर आज तक यह मैंगलोर विश्वविद्यालय में अच्छी तरह से कार्य कर रहा है। इसके द्वारा विभिन्न संस्थाओ के लिए विकिरण प्रयोग किए गए है।
3. बेहतर डिज़ाइन का माइक्रोट्रॅान, - माइक्रोट्रॅान में कई डिज़ाइन सुधार सफलतापूर्वक किए गए है। इनमें बीम प्रदर्शन की उच्च दोहराव, कैथोड जीवन में वृद्धि, बेहतर चुम्बकीय डिज़ाइन वक्र क्षमता और बीम कक्षाओं (orbits) के निदान के लिए बीम जांच की क्षमता का परिक्षण शामिल है।